Das mit den Gruppenrichtlinien kann ich leider nicht überprüfen, da es 'nur' Webspace und kein eigener Server ist, aber ich werde mal den Leuten dort ein Email schicken
Brauchst keine Mail schicken, denn dann lädst du deine Scripte per FTP hoch und dann sind die Gruppenrichtlinienen in Ordnung.
Meine Aussage diebezüglich ging davon aus das du einen eigenen Server zuhause bzw. einen Server mit vollen <root> Rechten hättest.
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Du beschreibst das du rewrite_rules benutzt um den Wiki in seiner URI definition umzuleiten.
nimm bitte dieses rewrite erstmal wieder raus, testen ob das wiki geht.
ich schätze das du den rewrite per .htaccess definierst, also hierbei noch genau nachlesen ob dein rewrite script auch richtig ist.
Zudem mittels anderer .htaccess befehle klären ob nicht vom Provider einige .htaccess definitionen geblockt werden.